两者登记部门不同,国有证的全称是国有土地使用证,它是在国土局核办的,而房产证是房屋所有权证,是在房屋管理中心核办的。两者权利作用不同:国有证是作用在房屋所在土地上的,代表拥有该土地的使用权,其权限是时间限制的,一般为40年、50年、70年。而房产证是作用与房屋本身的,代表拥有该房屋的所有权利,而且期限是永久的。